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如果苹果手机上的短信应用被删除，你可以尝试以下几种方法来恢复。
1、使用iCloud备份恢复：
如果你之前有设置iCloud备份并已经备份了短信数据，那么你可以通过恢复iCloud备份来找回短信。
进入设置 > 通用 > 还原 > 从iCloud备份恢复，然后选择最近的备份进行恢复。
这将会覆盖设备上的所有数据，所以请确保备份中包含了你需要恢复的短信并且没有其他重要数据的丢失风险。
2、使用iTunes备份恢复：
如果你使用iTunes对手机进行了备份，也可以通过恢复iTunes备份来找回短信。
连接手机到电脑，打开iTunes，然后选择设备并恢复之前的备份，同样地，这也将覆盖你设备上的所有数据，所以请确保备份中包含了你需要恢复的短信。
3、使用第三方数据恢复软件（非苹果官方方法，需慎重选择）：
市面上有一些第三方数据恢复软件可能能够帮助你找回删除的短信，但使用这些软件需要谨慎，因为它们可能存在一定的风险并且不保证一定能够恢复数据。
在使用任何第三方软件之前，请确保它们来自可信赖的源，并且先了解相关风险。
4、检查删除前的短信导出（如果适用）：
如果你在删除短信之前曾经导出过短信到电脑或其他设备，那么你可以从导出文件找回短信。
检查你的电脑或其他设备上的导出文件，看是否有备份。
无论使用哪种方法，恢复数据都不是百分之百保证的，并且有可能无法恢复某些数据，定期备份你的数据是非常重要的，以防止数据丢失，如果你不确定如何操作或担心数据丢失的风险，建议寻求专业人士的帮助。